678.9x
Transporte molecular en GPU
- Partí de una simulación de moléculas que avanzan por un canal estrecho y que ya existía en versión serial y en MPI (de un colega). Con 4 y 8 núcleos, MPI la aceleraba 3.6x y 6.4x, respectivamente.
- Yo la porté a GPU con CUDA: 678.9 veces más rápida que la versión serial.
- Esa velocidad permitió barrer más de 14,000 configuraciones y corregir un sesgo en el movimiento lateral que antes no se podía ver.
- Es el mismo método que aplico a un sistema de un cliente: medir dónde se va el tiempo, rediseñar lo que lo frena y comprobar la mejora con números.

Cuatro de los más de 14,000 escenarios que probé, cada uno con reglas distintas de entrada y salida del canal.


